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千赢千赢甲基化基因筛选及甲基化谱的建立

【作者】周穗子 彭杨 詹建东 邱前辉

【关键词】 千赢 千赢; 甲基化芯片; 基因; DNA甲基化;

摘要目的:通过甲基化芯片筛选出千赢千赢(AR)相关基因异常甲基化位点,探究DNA甲基化与AR的关系。方法:提取19例AR官网和11例正常下鼻甲黏膜组织DNA制成illumina甲基化芯片,通过筛选差异性甲基化位点、Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集和文献检索对所筛选的基因进行综合分析。结果:AR官网中出现的异常甲基化位点总共为94个,其中包括高甲基化位点51个(如ST7、LCE2D、ATRIP基因),低甲基化位点43个(如PIK3CG、TLR6、IL-4基因)。通过Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集分析提示DNA甲基化与AR有相关趋势,ST7、LCE2D、PIK3CG基因DNA甲基化可能与AR相关,GO分析与KEGG分析差异无统计学意义。另外结合文献,TLR6基因和IL-4基因DNA甲基化可能与AR发病相关。结论:通过高通量甲基化芯片,在AR下鼻甲组织标本中筛选出不同程度的甲基化基因,提示基因甲基化是AR发病的重要原因,其之间的关联情况仍需进一步千赢。 

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